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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

时不时算作矿业工业原料而被认识的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“消化吸收固体废物”是“遗迹小原子”的坚辛之路类似的,一直到近十几种年才被会发现其必要的生物技术学用途,从次“侧睡农奴把演唱”,非常是在免疫检测发病性发病学习方面内与时共进。已经几篇文献资料报导了在各种各样发病性发病的部分动物模特中接受衣康酸或其生物学修饰语衍生产品物技术的疗法益处,并会发现其暗藏靶点。观于衣康酸的“前世姻缘”与“今世”,详情文案《乳酸的奋斗史哥俩——衣康酸!篇文章陪你去知道衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应体现核蛋白组学产品,实现1000+举重若轻度体现位点排除,维持初现精品靶点,全位子生信解析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发觉”到“校验”全方法服务保障,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、测试的流程

02、试验数据统计

03、经“点”显现

在实际数据统计中,验出两个资料中简讯的经点靶点下列关于衣康酸体现位点,如第个个被感觉的衣康酸共价体现球核蛋白酶KEAP1,还糖酵解信号通路中的3个的关键所在酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或是炎性小体组成的球核蛋白酶NLRP3和组织细胞挫裂历程中的的关键所在球核蛋白酶RIPK3等,其质谱图相应图图示。

04、设备特征

1.多沉质控

金融业化特女性朋友电极孵育、SDS-PAGE论文检查测量、WB查验、样板相应的性研究分析等各个位论文检查测量,切实保障产品毕竟安全可靠性设计。

2.高功能质谱检测设备工作平台

在Orbitrap Astral全新一批高辨认质谱仪火供下,体现衣康碱化表达位点及球蛋白签别新长度,动力地理学探析新找到。

3.全流量一趟式服务项目

鉴于拜谱生物工程建全的研究系统,可供应“细胞核锻炼→电极孵育→WB监测→玄之又玄度衣康酸性反应淡化监测→特权生信阐述→相关位点PRM验正”全方法服務,省时省劲更皮实。

05、深入分析游戏内容(位置)

06、采用领域

PART 2、医学文献分享一下

参考文献一

因为小标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文版网站标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探讨资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文二

英文翻译标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文名字主题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

理论研究文章:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例子衍生品思维

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13存在强大的底物组合程度,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱动物衣康硝化作用体现组测评数据报告中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应表达(相应图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人心得体会

作为一个TCA无限循环中的中心消化吸收物,衣康酸调准消化吸收、免役和宫颈真菌感染之中的能够 做用,为制疗免役宫颈真菌感染性常见疫情保证了方式制疗机制。衣康酸框架中的亲电性α,β-不饱和点羧酸框架能对蛋清质上的生物半胱氨酸残基完成烷基化淡化(迈克尔加上化学反应),这一项翻译英语后淡化被叫作“衣康酸淡化(itaconation)”,必将决定蛋清质效果,房产调控免役初次应答和消化吸收途经,为种常见疫情用药科研保证新难点。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应淡化核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学完全参考值靶向疗法基础代谢组(QMT1000)或养分新陈消化吸收靶向疗法新陈消化吸收组新产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

分类专著

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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