
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原聚集MHC试述融入肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫抗体肽字段已经翻譯后遮盖的信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从早测序新技术,不依赖现有数据库,更快通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富的的数值定性分析方面为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递恶性肿瘤抗原的方式
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01 机制化研发
稿件标题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
发过期刊杂志:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)都是种核转换蛋清,在癌证中常常过理解,并且做好为癌肿發生的驱动器问题。近年,靶向治疗XPO1的小分子结构正被当作监床治癌类药物。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫细胞肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 那种来于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 肉瘤-抗体疗法
散文提题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
文章发表自媒体:Nature Communications IF:16.6 2023
梭形神经细胞良性肿瘤胸膜间皮瘤(MPM)不是种效果不好的的侵蚀性性良性肿瘤。仍然现存的开展方案格式不足的作用,对此迫在眉睫必须 新的开展营销策略。由此可见其T神经细胞侵及,小说拜谱生物假设检验MPM不是个适合使用的开展性癌证狂犬疫苗的学习目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用基本概念质谱的免疫系统肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶变胸膜间皮瘤免疫细胞肽组学检查
03 沙门氏菌mRNA接种疫苗联合开发
小文章问题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发表论文杂质:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过依据质谱的免役肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌妇科感染的Hela神经元和HCT-116神经元中认定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱个人心得体会
抗体癌组织结构癌组织结构肽组学是淀粉酶质组学的某个高速发展壮大的层次结构,它专心于钻研抗体癌组织结构癌组织结构系統中由其主要结构相融性和好体(MHC)或人类白癌组织结构抗原(HLA)碳原子呈递的抗体癌组织结构癌组织结构肽。这种抗体癌组织结构癌组织结构肽是癌组织结构外壁呈递的肽段,可能被T癌组织结构认别,因此捕获抗体癌组织结构癌组织结构响应。因为质谱的抗体癌组织结构癌组织结构肽组学己经加入鉴别MHC淀粉酶呈递肽的金要求做法,可能单独鉴别差异生理问题和病检工作状态下差异结构和癌组织结构的类型中的抗体癌组织结构癌组织结构肽组,举个例子片体瘤或电脑病毒皮肤感染的癌组织结构。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的血清组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫抗体肽组测试功能,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,要能精准的且进行给出免疫系统性肽回文序列,察觉到比较多非典型案例免疫系统性肽,逐一建立出正规新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
可以参考文献综述
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y