代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
因素评定费：产生组学水平也是也可以对中西药中的化工工业因素通过全部数据分析，评定费出成药中的抗逆性因素。假如，利于立于质谱（MS）的产生组学水平，是也可以评定费出长白山红参中的长白山红参皂苷等抗逆性因素。种水平还是也可以判别药用价值价值和非药用价值价值那部分的化工工业标出物，为中西药的产品控制提拱基本原则。
水平掌握：应用细胞排泄率组学水平，能够 对中草药的水平实施风险评估和掌握。列如，应用花草细胞排泄率组学概述，能够 开发建设应对类风湿骨痛性髋风湿病的中草药成份的水平标记符号的降钙素原检测技术。显然，细胞排泄率组学还能够 辨识中草药中的渗透性成份试述渗透性规则，如应用UPLC-Q-TOF-MS研发，区别多种乌头花草的物理化学完份，并辨识具镇痛药灵活性和突然渗透性的生物工程碱。
2. 中药药效机制研究
意义靶点识別：新陈代谢组学工艺也可以帮识別中药茶抗逆性含量的团伙靶点。如，调查出现雷公藤红素可采用改善Treg/TH1和Treg/Th17取舍、阻挡NF-κB径路等机能利用消除炎症意义。
反应共识新策略阐明：分解组学枝术才就可以论述西药疗法发病的反应共识新策略。假如，分析探讨显示青蒿素耐药肺结核与疟原虫的线粒体分解更改有关系联，非靶向治疗分解组学论述了与该环节有关系的分解物變化。虽然，分解组学还就可以利用定量分析分解物的變化，分析探讨西药复方的反应共识新策略。
3. 中药安全性评价
毒副作用考核新制度分析一下：分解组学科技就能够代替分析一下草药的毒副作用考核新制度。举列，经由分解组学和16S rDNA测序的优势互补分析一下，体现了了清益汤对危重发生亚急性胰腺炎涉及到发生亚急性肺受损的护理考核新制度，并判定了铁镇定自若、距离分解物和微细小微生物菌群中的的联系。
安全卫生卫生可靠性开展：代谢转化组学技木还应该运行于中药配方材的安全卫生卫生可靠性开展，掌握未知的致毒组分和致毒靶点，为了为中药配方材的安全卫生卫生可靠运行供给科学性重要依据。
4. 中医证候研究
证候涉及到的新陈产生物技术了解：新陈产生组学能力可应用在定量分析与中国传统医学药学证候涉及到的的内源性新陈产生物技术发展，辅助制作中国传统医学药学证候的珍断和诊治。举列，采用新陈产生组学深入分析，已在冠烦扰之处患病者中亲子鉴定出与痰瘀证随和阴两虚证涉及到的的生物技术象征物。
证候应对科学论述：分解组学高技术应用还就可以使用在科学论述中西药对中医针灸证候的应对效率。举个例子，依据分解组学高技术应用及聚类数据分析法数据分析法，出现“黄芪-茯苓-泽泻”等相互影向药剂剂量选型适使用在肾病终合征的新组方药剂剂量，要对不同肾病终合征涉及到的的生物体logo物所产生影向。
5. 多组学技术整合应用
多个学构建：核心代谢组学与某些组学技术性（如染色体组学、转录组学、蛋白质含量质组学等）的构建采用，为中西药才深入讲解出具没事个多层次的讲解骨架。各种构建采用一方面渐渐地普及和加深了我国对中西药才化学成分在团伙要素上对机体生理特点和病理学形态的影向，可是为探求中西药才的效用系统和药物东西核心出具了强有劲的平台。
慢性病缓解体系：多个学枝术行app于科研西药缓解慢性病的原子核体系。比如，能够 蛋白酶酶质组学和排泄组学的联手app，探求了与国医种类的膝髋膝关节骨性髋膝骨关节炎相互之间涉及到的不同体现蛋白酶酶和排泄通道。
排泄组学方法在中草药配方科研中的拜谱生物，为中草药配方的现如今化和精准性的医辽提供数据了重点的科学的支持软件，助于推动中草药配方的的规范化管理和国际性化经济发展。