
2024年9月由广州种植业本科大学张万刚先生专业团体在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物技术为该研究提供了亚硝基化表达组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文字幕副标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202多年直接影响指数公式:5.7
发表论文耗时:2024年9月
潜在客户计量单位:南京农业大学
探析的原材料:蛋白
拜谱带来系统:亚硝基化修饰组学
技能路经:
一、钻研没想到
01.Caspase-3亲水性
到目前为止尚不明了NO对caspase-3的克定制用有不存在归因于NO介导的S-亚硝基化,的不同溶液浓度等度的GSNO作外源性NO生产,以诱惑caspase-3的体内S-亚硝基化。最终证实,与不存在GSNO的组相信,100、200和400μM GSNO组的caspase-3生物取得变低(图1),与之前通讯稿不一样。GSNO进行处理变低caspase-3生物的潜在的的原因仍仍待体现了。
图1 多种含量的GSNO操作对caspase-3生物的影响到
02.Caspase-3的S-亚硝基化层度
深入分析Caspase-3的亚硝基化限度,以揭示GSNO对Caspase-3的不良反应性。经GSNO正确处理后,探测到caspase-3蛋清S-亚硝基化抗拉强度上升(图2)。他们效果取决于,外源性GSNO培养出来可取得成功成脂caspase-3的离体S-亚硝基化。这令咋舌的是,在没了GSNO具备的对应组中探测到两个变弱的S-亚硝基化带,这取决于caspase-3概率会发生内源性的S-亚硝基化。于此,本深入分析中caspase-3的S-亚硝基化限度较高,而caspase-3的炎症因子朋友减少,这与之间的深入分析完全一致。殊不知,caspase-3的炎症因子朋友S-亚硝基化表达位点尚不知晓,还所需进1步的思考。
图2 GSNO操作对caspase-3S-亚硝基化技术的干扰
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化呈现组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。绿色箭头的字段表现S-亚硝基化肽,紫色箭头的C表现S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结血清
结核淀粉酶酶看作那种非常非常重要的神经元核骨架核淀粉酶酶,在恢复肌神经元核空间设备构造的空间设备构造完好性和内缩性各方面起着非常非常重要效应,探究S-亚硝基化caspase-3对结核淀粉酶酶光分解的皮肤敏感度认识体现了非常非常重要积极意义。与Std(未用胱天核淀粉酶酶酶-3和GSNO孵育的初使肌玻纤核淀粉酶酶)组比起来,0 μM GSNO组(肌原玻纤和caspase-3的孵育,无GSNO)的完好结核淀粉酶酶有机废气浓度更为比较突出拉低,提醒caspase-3对结核淀粉酶酶体现了暗藏的核淀粉酶酶淀粉水解技能。在GSNO孵育后,完好结核淀粉酶酶的有机废气浓度比较突出加入(P < 0.05)。于此,当GSNO有机废气浓度提高时,完好结核淀粉酶酶的有机废气浓度持续保持上涨(P < 0.05)(图5)。某一表示表示,SNO体现的caspase-3以水准依赖症的方式英文缓和结核淀粉酶酶的光分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3生物降解肌钙蛋白质-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清调管理手臂肌肉抽缩的丝条的须要肌原食物仟维蛋清。TnT的挥发塑料特征描述是查重到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提下,caspase-3对TnT的挥发塑料情况发生长为6右图,与Std组(包涵caspase-3和GSNO的肌原食物仟维)比起,caspase-3组中30 kDa TnT场面描写不错不断增加,证明caspase-3体验了TnT的挥发塑料,除外,caspase-3与GSNO的孵育引发30 kDa TnT变低。在100和200 μM GSNO组范围内沒有查重到偏态的的差异性(P > 0.05),而当GSNO的质量浓度实现400 μM 时,该场面描写不错才能减少(P < 0.05)。等等得知证明了SNO遮盖的caspase-3对TnT挥发塑料的克制作方法用。结蛋清和TnT是caspase-3的太敏感底物,而GSNO清理变低caspase-3的可溶性有机会引发肌原食物仟维蛋清挥发塑料水平变低。综合上面的上述一系列的,NO引发的S-亚硝基化会可以通过遮盖半胱氨酸残基来调caspase-3的可溶性,而能进这一步后果其对结蛋清和TnT的蛋清水解反应专业能力,故而后果牛肉片品味。
图6. S-亚硝基化caspase- 3化学降解肌钙蛋白质-T
二、个人总结
本研发重在研究S-亚硝基化对caspase-3遮盖的关系到以至于那么对鸡肉肌原弹性纤维棉身体化学降解的关系到。球蛋白质酶S-亚硝基化能遮盖caspase-3的半胱氨酸残基,才能诱发caspase-3灵活性影响,更加骤调控了其对鸡肉肌原弹性纤维棉球蛋白质酶的球蛋白质酶电离学习能力。三、拜谱个人心得体会
科研用了酶活测定方法,亚硝基化掩盖组学定性分析,WB等探测手法,找到蛋清S-亚硝基化可掩盖caspase-3的半胱氨酸残基,这会导致了caspase-3活力性的减低,相结一点控制了其对鸡肉肌原纤维素蛋清的蛋清电离效果。本科研为解释清楚蛋清质亚硝基化对色泽的调空长效机制展示半个个新的视觉。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、突显蛋清质组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸型号软件,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total阳极氧化保存、解离巯基,欢迎大家咨询!
考虑毕业论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663