
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
调查没想到
研究探讨人员管理科学探究渐渐冷冻耗时间隔添加羊肉的氏洛氏硬度、持反击式水轮机、光色、徘徊铁含氧量、ROS、脂质过防金属氧化物、MDA、GSH和GPX4程度来评价腿部肌肉组织化上皮内部的铁死忙状态下。毕竟展示,冷冻耗时间隔添加后,羊肉的氏洛氏硬度在第5天和第6天明显回落;持水力拉低;有颜色变深,流失有光泽度,鲜蓝色变的暗蓝色。与此同时,徘徊铁、活性氧氧和MDA的含氧量明显添加,上皮内部凋亡率明显上升。 深入研究人士分离出来的有对比冷藏箱日期的健身肌肉群样件的膳食纤维酶质,之后实施SDS-PAGE研究,膳食纤维酶质条带在的有对比期间数据分布不均且似的(图1a)。随着膳食纤维酶在的有对比样件中的把你想表达出来现象,研究会发现不同组样件的中五位数非常接近于不同的水平(图1b),讲解健身肌肉群样件膳食纤维酶质兼有较好的组内似的性和组间对比性。 血清质组学共技术鉴定费费出1996种血清质。以B0为比对组,需求B1、B2、B4和B6中的血清展开地域不同理解概述,共技术鉴定费费到376个DEPs。将火山图可视化讲解,并按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05三个原则概述DEP。毕竟如图是1c-f表示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别技术鉴定费费出22、33、73和140个DEPs,之中别上涨6、11、32和8九个,变动16、22、41和52。聚类分析法最简单的方法分析了各不相同冰箱时段.背部健身肌肉组织开展中血清质的理解,毕竟表现背部健身肌肉血清理解地域不同不断地店铺事件的上升而上升(图1g)。
图1| 区别要在冷藏室保存时的肌肤图纸淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各不相同冷藏库耗时的健身肌肉产品的样品不同蛋白质浅析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁阵亡蛋白酶肽的PRM按量分享(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 根据KEGG含有差别表明球蛋白的铁消亡机制化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT酶联免疫法球核苷酸组学方法保障,拜谱生物学已精准服务研发完成任务并实现了改善比较成熟的转录组学、球蛋白质组学、产生组学各种两组学携手精准服务方法保障网络体系,欢迎致电咨询!
可以参考论文资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.